Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYSRT1A8MQ03 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYSRT1A8MQ03 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms