Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM88BA6NKF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM88BA6NKF7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms