Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms