Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCNX2A6NKB5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms