Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L4A6NEF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms