Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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SH3BP1Q9Y3L3 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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