Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SHOC2Q9UQ13 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms