Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ECM1Q16610 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ECM1Q16610 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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