Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
E2F4Q16254 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms