Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USF2Q15853 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
USF2Q15853 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USF2Q15853 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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