Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALX1Q15699 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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ALX1Q15699 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALX1Q15699 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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