Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRKD1Q15139 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms