Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SMCO1Q147U7 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SMCO1Q147U7 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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