Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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