Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARB2Q14108 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms