Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL9A3Q14050 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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