Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CDK13Q14004 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
CDK13Q14004 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms