Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TOP3AQ13472 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TOP3AQ13472 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TOP3AQ13472 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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