Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms