Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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