Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CBX3Q13185 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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