Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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TRAF1Q13077 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRAF1Q13077 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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