Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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