Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX13Q9Y5W8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNX13Q9Y5W8 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX13Q9Y5W8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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