Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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HCN4Q9Y3Q4 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HCN4Q9Y3Q4 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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