Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1Q9UJ41 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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