Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CTDSP1Q9GZU7 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTDSP1Q9GZU7 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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