Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
RTN1Q16799 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTN1Q16799 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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