Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNGA3Q16281 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNGA3Q16281 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNGA3Q16281 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNGA3Q16281 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CNGA3Q16281 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNGA3Q16281 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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