Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HDAC1Q13547 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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