Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HSPB3Q12988 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HSPB3Q12988 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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