Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NFIAQ12857 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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