Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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KCNMA1Q12791 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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