Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CACNB1Q02641 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms