Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPREP23469 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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