Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PSDA5PKW4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms