Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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LHX9Q9NQ69 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
LHX9Q9NQ69 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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