Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SNX29Q8TEQ0 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms