Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TAF1AQ15573 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TAF1AQ15573 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms