Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NWD1Q149M9 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NWD1Q149M9 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms