Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNC3Q14003 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms