Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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NR1H3Q13133 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NR1H3Q13133 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NR1H3Q13133 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NR1H3Q13133 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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