Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD8P13378 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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