Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PSDA5PKW4 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PSDA5PKW4 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms