Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms