Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NKX1-1Q15270 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NKX1-1Q15270 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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