Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PDE6HQ13956 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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PDE6HQ13956 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PDE6HQ13956 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PDE6HQ13956 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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