Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNTA1Q13424 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNTA1Q13424 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNTA1Q13424 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SNTA1Q13424 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNTA1Q13424 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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