| MPP3 | Q13368 | RN7SKP258-201 | ENST00000517151 | 304 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC040936.1-201 | ENST00000534543 | 172 nt | TSL 5 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR15A-201 | ENST00000607334 | 83 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL136164.4-201 | ENST00000625013 | 2135 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | MINPP1-204 | ENST00000536010 | 2215 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RBM39-201 | ENST00000253363 | 2488 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | PWAR6-201 | ENST00000552334 | 4618 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | ATP2B1-203 | ENST00000393164 | 3127 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | ANKRD26P2-201 | ENST00000445530 | 1710 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | LRRC6-212 | ENST00000618342 | 1754 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RAPGEF6-202 | ENST00000308008 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-371P-201 | ENST00000364283 | 108 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | SET-203 | ENST00000372688 | 801 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | TRAV39-201 | ENST00000390466 | 331 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | TRAJ17-201 | ENST00000390520 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | LGALS16-201 | ENST00000392051 | 624 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6ATAC-201 | ENST00000408749 | 126 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP000473.1-201 | ENST00000413645 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC004870.4-201 | ENST00000424359 | 360 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC096644.2-201 | ENST00000429278 | 159 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL158071.1-201 | ENST00000430315 | 461 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | NDUFB4P6-201 | ENST00000436819 | 366 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | TRAPPC2P8-201 | ENST00000440676 | 396 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL139383.1-203 | ENST00000445227 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU7-187P-201 | ENST00000458985 | 68 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP310-201 | ENST00000459084 | 116 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL21P41-201 | ENST00000459863 | 264 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC096745.1-201 | ENST00000509945 | 370 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC104136.1-201 | ENST00000512969 | 394 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP380-201 | ENST00000517190 | 98 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | PKIA-203 | ENST00000518467 | 588 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC087854.1-201 | ENST00000519706 | 414 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | LINC01965-204 | ENST00000545549 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC023906.2-201 | ENST00000558343 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC113195.1-201 | ENST00000579952 | 141 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC090398.1-202 | ENST00000580403 | 457 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL121772.2-201 | ENST00000614331 | 297 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | U4.1-201 | ENST00000620349 | 87 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| MPP3 | Q13368 | CUL1P1-201 | ENST00000509510 | 2425 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MBNL1-223 | ENST00000498502 | 5258 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | DMD-201 | ENST00000288447 | 3856 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | KNTC1-204 | ENST00000436959 | 2412 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.2-201 | ENST00000362330 | 96 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-490P-201 | ENST00000362985 | 107 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.80-201 | ENST00000362996 | 102 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-842P-201 | ENST00000384269 | 107 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.485-201 | ENST00000384395 | 102 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC239803.1-203 | ENST00000411978 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | HNRNPDLP1-201 | ENST00000412834 | 550 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC080125.1-201 | ENST00000414888 | 684 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL21P90-201 | ENST00000415692 | 466 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | NUP35P1-201 | ENST00000422734 | 947 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL513365.2-201 | ENST00000423060 | 529 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC007566.1-201 | ENST00000427458 | 643 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | TAB3-AS1-201 | ENST00000428263 | 245 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | CBX3P6-201 | ENST00000430257 | 527 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | NRG3-AS1-201 | ENST00000448936 | 555 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC128713.1-201 | ENST00000471495 | 306 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-95P-201 | ENST00000516357 | 160 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-128P-201 | ENST00000516704 | 160 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC026333.2-201 | ENST00000542164 | 106 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | ELOCP5-201 | ENST00000604924 | 333 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC018889.1-201 | ENST00000605372 | 397 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC022149.2-201 | ENST00000621061 | 203 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | CPXCR1-202 | ENST00000373111 | 1577 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | P2RY13-201 | ENST00000325602 | 2764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | FOXP2-206 | ENST00000393491 | 6085 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | SULT1B1-201 | ENST00000310613 | 7115 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.151-201 | ENST00000363566 | 112 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-214P-201 | ENST00000384130 | 107 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.455-201 | ENST00000384230 | 98 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR578-201 | ENST00000384828 | 96 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-817P-201 | ENST00000391083 | 104 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1197P-201 | ENST00000391183 | 107 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MRPS18CP6-201 | ENST00000423587 | 223 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | CYCSP4-201 | ENST00000429682 | 331 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL138916.1-201 | ENST00000436295 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MACC1-AS1-201 | ENST00000439285 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL360271.2-201 | ENST00000447710 | 161 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC006483.1-201 | ENST00000487308 | 313 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MTND3P25-201 | ENST00000509243 | 135 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | LINC01256-201 | ENST00000513270 | 508 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1256P-201 | ENST00000516539 | 103 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-635P-201 | ENST00000516651 | 102 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC127894.1-201 | ENST00000548266 | 851 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC004024.1-201 | ENST00000549244 | 247 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AF111169.4-202 | ENST00000553507 | 262 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL513302.2-201 | ENST00000562313 | 1842 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008962.1-201 | ENST00000605729 | 304 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR7851-201 | ENST00000610611 | 160 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | CHM-205 | ENST00000615443 | 2821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC068831.7-201 | ENST00000616954 | 363 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC105265.4-201 | ENST00000618391 | 306 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |