Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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IFT88Q13099 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IFT88Q13099 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IFT88Q13099 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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