Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
EPHB4P54760 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
EPHB4P54760 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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